chemwin 6.0(化学结构式绘图软件)，德国SoftShell公司开发，其中的ChemWindow是最早的有机分子结构绘制软件。
ChemWindow6.0版本后整合到GlassyChemistry 2000，还可以用来构建和组装二维的实验室玻璃器皿和实验装置图，实验仪器装置可以是彩色的，形象十分逼真。
非常不错的分子式绘制软件，现在的版本结构绘制功能比以前增强了很多，特别是有机方面的分子结构用它来做非常快捷方便。该软件主要功能是能绘出各种结构和形状的化学分子结构式及化学图形，具有一般其它绘图软件所不具备的化学分子图形编辑功能。由于Windows环境下具有的友好用户界面和便利的切换功能，使得其资料可共享于各软件之间。 该软件在绘制化学专业图形方面使用方便且功能强大，可免去许多人工手绘化学分子图形之苦，为日常的教学和科研带来许多方便，该软件与Microsoft Word、Power Point 等软件朕用，可出色地完成一般化学科技论文的编印及制作出漂亮的专业幻灯片，为化学工作者带来极大便利。
ChemWindows化学绘图软件还附有详细的化学元素周期表，提供了分子结构式的检查、分子量计算和给出分子式formula，打开“other菜单，选择“check syntax，如其发现分子式中存在不合规律的结构光标就会出现在有疑问的部位，以便你检查后修改，选择“Calculate Mass即可给出分子式formula和分子量。
为了提供更多的工具而又保持桌面简洁，chemWindows提供了许多后备的预制分子结构及符号，这些预制分子结构及符号存放在以cw2为扩展名的文件中，我们也可将自己常用的分子结构加入其中，使用时通过File菜单的Load加载，工具栏中就会添加这些预制分子结构及符号，这大大简化了创作步骤。
分子式与同分异构体区别
分子式(molecular formula)是用元素符号表示物质（单质、化合物）分子的组成及相对分子质量的化学式。
分子式和最简式不同，对化合物来说，它们的分子式是最简式的整数倍，或者说相对分子质量是最简式式量的整数倍。仅当相对分子质量和最简式式量相同时，最简式才和分子式相同，这时最简式就是分子式。
当分子式相同时，也有可能不是一种物质，它们有可能是同分异构体。
同分异构体与结构式区别
化学上，同分异构体是一种有相同化学式，有同样的化学键而有不同的原子排列的化合物。简单地说，化合物具有相同分子式，但具有不同结构的现象，叫做同分异构现象；具有相同分子式而结构不同的化合物互为同分异构体。很多同分异构体有相似的性质。
同分异构体又称同分异构物。在化学中，是指有着相同分子式的分子；各原子间的化学键也常常是相同的；但是原子的排列却是不同的。也就是说，它们有着不同的“结构式”。许多同分异构体有着相同或相似的化学性质。同分异构现象是有机化合物种类繁多数量巨大的原因之一 。
同分异构体的组成和分子量完全相同而分子的结构不同、物理性质和化学性质也不相同 。
