生物分子数据可视化工具Caleydo,数据可视化工具,旨在分析和比较,探索关系的多个数据集之间的数据。
Caleydo 是一个功能强大的应用程序,允许您标识的相互依赖性,从多个生物分子数据集。该程序允许您可视化和探索途径,以便分析用最省力的临床数据。此工具可以通过可视化的数据地图揭示的分组或数据集之间的关系。
(1)时间性 对于新发表的数据,应该能够在很短的时间内(几个小时至几天)通过国际互连网访问。
(2)注释 对于每一个基本数据(如序列),应附加一致的、深层次的辅助说明信息。
(3)支撑数据 在有些情况下,数据库使用者需要得到原始的实验数据,因而要提供访问原始数据的方法。数据库中应包含原始数据,或者能够通过交叉索引访问实验数据库中的原始数据。
(4)数据质量 必须保证数据库中数据的质量,数据库管理机构应对数据来源进行检查,并且关注数据库用户和专家提出的意见。
(5)集成性 三种基本生物分子数据库(核酸序列、蛋白质序列、蛋白质结构)的集成对于用户来说是非常重要的。对于数据库中的每一个数据对象,必须与其它数据库中的相关数据联系起来,这样可以从某些分子数据出发得到一系列的相关信息。例如,从某个核酸序列出发,通过交叉索引,可进一步得到对应的基因、蛋白质序列、蛋白质结构,甚至得到蛋白质功能的信息。
生物分子泛指生物体特有的各类分子,它们都是有机物。典型的细胞含有一万到十万种生物分子,其中近半数是小分子,分子量一般在500以下。其余都是生物小分子的聚合物,分子量很大,一般在一万以上,有的高达10,因而称为生物大分子。