慧源医院软件合作医疗版药品管理系统是一款医院的医用药品管理的系统软件。体积小，但功能强大。界面非常清爽，简单易操作。
1、药房：门诊处方发药、门诊处方退药、门诊处方修改(西药中成药房)、门诊处方修改(中草药方)、门诊处方查询、住院处方发药、住院处方退药、住院处方修改(西药中成药房)、住院处方修改(中草药方)、住院处方查询、
2、库存：药品入库、药品退库、药品库存明细、药品库存月报表、药品有效期检测、药品库存统计表(含失效期报警)、期初库存设置、期出库存修改、库存药品价格调整、药品出库价格统计表、药品字典
3、报表：药房直接入库单查询、药房直接退库单查询、门诊医师药品分类金额统计表、门诊药房利润查询、门诊药房特殊药品交接报表、住院医师药品分类金额统计表、住院药房利润查询、住院药房特殊药品交接报表、住院分科发药统计表、出入库分类报表、出入库明细报表、工作量统计、处方出库统计、多功能查询，各种报表可由XML导出，可用EXCEL进行编辑
4、系统：修改密码、报表打印参数管理、登陆数据库服务器、登陆系统
5、帮助：帮助主题，查看【慧源软件】最新动态、软件注册、关于、退出。
根据市场需求，慧源软件在慧源医院系统小型网络版基础上，针对新型农村合作医疗的功能需求，对《医院信息系统（合作医疗版）》进行了统一的整体设计，一方面扩充和完善原的数据库，另一方面整合新的数据流程，增加新的功能。这些新的功能主要是：在“门诊收费”中新增“合作医疗收费”功能；在“住院收费”中新增“参合人入院”功能、“参合人出院结算”功能；在“系统维护”中新增“合作医疗帐户管理”功能、“合作医疗帐户成员管理”功能、“合作医疗筹集资金管理”功能等等，从而形成这套《医院信息系统（合作医疗版）》。
本软件新增的“超级查询”功能，大大方便了用户的操作使用。
